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植物生長與分化容易受到環境變化影響，為了能因應環境的變化，植物已知可藉由訊息接收及傳遞，在不同層面來調控基因表現以控制生理及形態，目前相關研究相當多，但在訊息RNA剪接層面調控的機制了解卻很少。

  替代性RNA剪接 (alternative splicing) 是真核生物中常見的機制，可以利用同樣的訊息RNA 前驅物 (pre-mRNA)，在不同的剪接位進行剪接後，形成多條的訊息RNA，此機制大幅增加了轉錄體 (transcriptome) 及蛋白質體 (proteome) 的複雜度及多樣性。替代性RNA剪接可被剪接調控蛋白 (splicing regulator) 及調控序列 (regulatory cis element) 所影響，這幾年植物的轉錄體的相關研究雖已發現存在大量的替代性訊息RNA，然而對替代性RNA剪接的調控機制所知不多，其是否對植物抗逆境反應有幫助亦是未知。

  我們近幾年利用系統生物學的研究方法，探討環境因子對植物體內替代性RNA剪接的影響。除了證實光線的確調控特定基因群的替代性RNA剪接，也發現光受器 (photoreceptor) 參與調控機制。目前我們利用功能性分析、生物化學及系統生物學的研究方法，探討光受器控制訊息RNA剪接的分子機制及其生理意義。希望這些研究可以幫助了解光受器調控訊息RNA剪接模式，以及此機制在植物的演化過程，最終利用此調控機制控制農作物的生長及分化。由於替代性剪接在植物不同生長階段都有參與調控，以開花時間的控制為例，如果更深入的探討與了解替代性剪接調控開花時間的機制，或許可以用此控制植物開花時間，目前研究團隊正就此方向進行研究。